امیر جلال الدین چخماق در قرن نهم با کمک همسر خود همت به احداث این میدان می گمارد. هدف امیر جلال الدین چخماق از احداث این مجموعه، رونق کسب و کار و کمک به آبادانی شهر یزد بود. بعد از آن، در دوران صفویه، بازسازی ویژه ای در مجموعه میدان امیر چخماق صورت می گیرد. از جمله این تغییرات و بازسازی ها، می توان به ایجاد بخش ویژه برای کاروانسرای این مجموعه اشاره کرد. این میدان در دوران  صفویه نیز به همین اسم خوانده می شد. از دیگر تغییرات اساسی مجموعه میدان امیر چخماق یزد، می توان به تبدیل بخش ابتدایی بازار به حسینیه را نام برد. پس از آن، در زمان قاجار نیز بازسازی هایی صورت گرفت و بخش هایی به شبستان مجموعه اضافه شد.